Видео после резки и склейки рассыпается на кубики и то

Правильно ли я понимаю, что вы сначала сохраняете несколько фрагментов, затем соединяете их используя Менеджер склейки?

в основном делаю так, но бывает и просто вырезаю ненунжные фрагменты и сохраняю весь файл.

Здравствуйте, Uran79!

Правильно ли я понимаю что вы используете последнюю бета версию, доступную по ссылке:

http://www.solveigmm.com/download/SolveigMM_Video_Splitter_Home_Edition_6_1_Beta.exe

Не могли бы вы загрузить данное видео на какой-нибудь сервис передачи файлов, например, Google drive?
Правильно ли я понимаю, что вы сначала сохраняете несколько фрагментов, затем соединяете их используя Менеджер склейки? Или вы сразу же выбираете фрагменты и сохраняете их вместе в режиме Keep нажав кнопку Save?

Доброго времени суток.
После сохранения фрагментов из видео и последующей склейки м/у собой изображение довольно часто рассыпается на артефакты/кубики, выпадает и тормозит. 
Рассыпается и на телевизоре и на компьюторе (i5370k, видеокарта - 560ti)
На исходном видео артефактов нет.

Сохраняю в формат ts.
Версия программы самая последняя
Windows 7 x64.

Вот свойства файла:
General
ID                          : 0 (0x0)
Complete name               : \\PERSONALCLOUD\Seagate (USB)\DISCOVERY\Гений Автодизайна.ts
Format                      : BDAV
Format/Info                 : Blu-ray Video
File size                   : 2.18 GiB
Duration                    : 43 min 43 s
Overall bit rate mode       : Variable
Overall bit rate            : 7 128 kb/s
Maximum Overall bit rate    : 18.7 Mb/s

Video
ID                          : 4113 (0x1011)
Menu ID                     : 1 (0x1)
Format                      : AVC
Format/Info                 : Advanced Video Codec
Format profile              : High@L4
Format settings, CABAC      : Yes
Format settings, ReFrames   : 4 frames
Codec ID                    : 27
Duration                    : 43 min 43 s
Bit rate                    : 6 453 kb/s
Width                       : 1 920 pixels
Height                      : 1 080 pixels
Display aspect ratio        : 16:9
Frame rate                  : 25.000 FPS
Standard                    : Component
Color space                 : YUV
Chroma subsampling          : 4:2:0
Bit depth                   : 8 bits
Scan type                   : Interlaced
Scan type, store method     : Separated fields
Scan order                  : Top Field First
Bits/(Pixel*Frame)          : 0.124
Stream size                 : 1.97 GiB (91%)
Color range                 : Limited
Color primaries             : BT.709
Transfer characteristics    : BT.709
Matrix coefficients         : BT.709

Audio
ID                          : 4352 (0x1100)
Menu ID                     : 1 (0x1)
Format                      : AC-3
Format/Info                 : Audio Coding 3
Mode extension              : CM (complete main)
Format settings, Endianness : Big
Codec ID                    : 129
Duration                    : 43 min 43 s
Bit rate mode               : Constant
Bit rate                    : 384 kb/s
Channel(s)                  : 6 channels
Channel positions           : Front: L C R, Side: L R, LFE
Sampling rate               : 48.0 kHz
Frame rate                  : 31.250 FPS (1536 spf)
Bit depth                   : 16 bits
Compression mode            : Lossy
Stream size                 : 120 MiB (5%)